动植物基因组重测序
产品介绍
经典案例一
经典案例二
常见问题

简介:

    基因组重测序是对已知基因组序列物种的个体进行基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行比较基因组学分析。通过全基因组重测序可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNPs)、插入缺失(InDel)、结构变异(Structure Variation,SV)等变异信息,广泛应用于群体遗传学、临床医药、动植物分子育种等众多领域。

 

 一、技术路线

 

 

Illumina Miseq、Illumina HiSeq2000

 

二、生物信息分析

 

1. 原始数据整理、过滤及质量评估

 

2. 基因组重测序分析:
    ♦与参考基因组比对
    ♦SNPs和InDel的检测
    ♦SNPs和InDel的注释

 

3. 根据客户需求进行个性化分析

 

三、结果展示

 

 

 
 

四、样品要求

 

1、DNA样品:Miseq DNA PE文库浓度≥20 ng/μl,总量≥6 μg(荧光定量);Miseq DNA MP文库浓度≥40 ng/μl ,总量≥12 μg(荧光定量);454 DNA库浓度≥20 ng/μl,总量≥3 μg(荧光定量),电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整,主带应在100 kb以上。若样品中有多糖、糖蛋白的残留,对打断DNA样品带来非常大的困难,且很难去除,因此特别要求所提供的样品不要有多糖或糖蛋白污染。


2、动物样品:对于一般物种应挑选肝脏、肾脏、血液等组织取样,对于珍贵物种请提供耳样、毛发(带毛根)等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续拼接产生的影响,尽量从同一个个体中取样。若物种体积较小,从一个个体中提取的DNA量不能满足测序实验所需,在保证量的前提下,应尽量减少采样个体的数量。提供组织样品应>500 mg,尽量提供较多量,不同的物种DNA提取产量有差异。


3、植物样品:植物材料应尽量选取植物组织幼嫩部位。提供组织样品应>500 mg,尽量提供较多量,不同的物种DNA提取产量有差异。

 

四、派森诺优势

 

1、丰富的基因组重测序及分析经验。

 

2、可根据实际需求个性化定制测序及分析方案。