菌种鉴定技术服务
产品介绍
经典案例一
经典案例二
常见问题

细菌16S rDNA菌种鉴定 细菌的rRNA有5S,16S,23S三种。其中5S rRNA信息量少,不适合分析,而23S rRNA分子量大,但碱基突变速率要比16S rRNA快得多,对于较远的亲缘关系不适用。16S rRNA其大小在1,500 bp左右,所代表的信息量适中,因此是进行分类研究的理想材料。 

利用16S rDNA两端的引物PCR扩增未知菌株的16S rRNA基因,并进行DNA测序,与GenBank中的已知序列进行同源性比较后,判定细菌种类,将细菌划分到属或种。

 

■ 服务内容

◇ 细菌16S rDNA部分序列解析
扩增细菌16S rRNA的全长序列,只进行一个测序反应(有效序列500~600 bp),即可得到含有部分种属特异性的16S信息,是一种较为经济便捷的鉴定方法。


◇ 细菌16S rDNA全序列解析
扩增细菌16S rRNA的全长序列,约1,500 bp左右,需进行三个测序反应,以得到较为全面的种属特异性信息。

 

■ 服务说明

1. 我们目前接收的样品形式为:基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。其它形式样品实验成功率较低,所以我们暂不接收。

2. 基因组DNA的浓度不低于10 ng/μl,总体积不少于20 μl,且无明显降解。平板或斜面应长有分离纯化的单菌落。

3. 由于革兰氏阳性细菌的细胞壁较厚,采用试剂盒常规方法较难破壁,如不提供基因组DNA,暂时不接受该类菌的鉴定。

4. 对于特殊菌株(如厌氧菌、放线菌等),请详细加以说明。

5. 样品建议您使用冰袋运输。

6. 如果测序结果出现背景峰或套峰,视为样品不纯,本公司将收取 全额实验费用。

 

■ 价格·实验周期

服务项目

收费标准

实验周期

细菌16S rDNA部分序列解析

400 元/样品

10个工作日

细菌16S rDNA全序列解析

600 元/样品

10个工作日

注:以上实验费用及周期是针对正常实验样品制定的,样品特殊或样品多时除外。

 

■ 提供结果

实验报告(包括PCR产物照片、菌种鉴定NCBI参考结果等)、测序彩色波形图、测序方向图、序列碱基图、保存电子版结果的CD光盘。