CircRNA测序
产品介绍
经典案例一
经典案例二
常见问题

产品介绍

circRNA(Circular RNA,circRNA),为一种特殊的非编码RNA分子,呈闭合环状结构。广泛存在于生物体内,与线性RNA相比,稳定性高,circRNA对microRNA具有重要调控作用。利用高通量测序技术可鉴定circRNA在生物样本中的种类、表达丰度及结构,推动circRNA研究的发展。

技术路线

测序平台

Illumina HiSeq平台,Illumina NextSeq 500平台

分析内容

分析项目

分析项目

原始数据整理、过滤及质量评估

circRNA差异表达分析

参考基因组注释信息整理

差异circRNA GO富集分析

比对到参考基因组及结果评估

差异circRNA KEGG富集分析

eggNOG分类分析

差异circRNA 聚类分析

circRNA筛选

microRNA结合位点分析

circRNA表达量统计

组间共有特有差异circRNA可视化

circRNA来源基因分析

 

结果展示

差异circRNA来源基因KEGG富集分析

在生物体内,不同基因相互协调行使其生物学功能,通过Pathway显著性富集能确定候选靶基因参与的最主要生化代谢途径和信号转导途径。KEGG(KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes)是有关Pathway的主要公共数据库。Pathway显著性富集分析以KEGG Pathway为单位,应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在候选靶基因中显著性富集的Pathway。

差异circRNA来源基因KEGG富集分析

纵坐标为KEGG Pathway条目;横坐标为Richfactor,图中圆点的大小表示注释到该通路的差异circRNA基因的多少,颜色表示该通路的显著性P值。图中展示的是结果里最显著的20个通路。

组间共有特有差异基因可视化

组间共有特有差异基因可视化展示了各组之间两两比较的差异基因表达情况,适用于三组及三组以上的样本量。

组间共有特有差异基因可视化