芬兰科学家利用转录组测序揭示前列腺癌中重要调控因子

 
   近日,芬兰坦佩雷理工大学科学家Antti Ylipää等利用高通量测序技术对前列腺癌患者进行转录组测序,发现前列腺癌中的重要调控lncRNA——PCAT5,PCAT5可作为去势难治性前列腺癌(CRPC)的生物分子标记。文章于2015年8月17日发表在Cancer Research(影响因子9.329)杂志上。

前列腺癌是男性常见恶性肿瘤,在某些国家和地区发病率高于肺癌等居首位,并呈逐年上升的趋势。对于前列腺癌患者在诊断时大多已发展到中晚期,虽然通过内分泌治疗可以使病情得到缓解,但多数前列腺癌患者会发展成去势难治性前列腺癌,去势难治性前列腺癌患者预后极差。去势难治性前列腺癌是国际医学界面临的科学难题,缺乏有效的治疗手段。

Antti Ylipää等通过高通量测序手段,利用Illumina公司HiSeq 2000测序平台对12个良性前列腺增生(BPHs)患者样本、28个未经治疗的前列腺癌(PCs)患者样本和13个去势难治性前列腺癌(CRPCs)患者样本进行转录组测序。本研究新发现145个未经注释的lncRNA或同源异构体(isoform)序列,其中三分之一的序列为CRPCs特有。

作者发现PCAT5为特异性的lncRNA,仅存在于靶标转录因子ERG-positive前列腺癌患者样本和去势难治性前列腺癌患者样本中,PCAT5作为新发现的致瘤lncRNA,调节靶标转录因子,并参与细胞的生长、迁移和细胞凋亡等。

此外,利用聚类分析和主成分分析等方法揭示不同样本之间关键通路的基因表达量变化;对前列腺癌样本和去势难治性前列腺癌样本中新发现的差异表达lncRNA的表达量进行检测;抑制PCAT5的表达会导致ERG-positive前列腺癌细胞的生长、迁移能力的降低。

本文通过转录组测序为去势难治性前列腺癌提供生物分子标记,对临床治疗具有重要的指导意义

原文索引:

http://cancerres.aacrjournals.org/content/early/2015/08/15/0008-5472.CAN-15-0217.full.pdf+html?sid=03a5406c-8876-4535-b0f3-09a219dfc537

本文由王智健博士整理