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科研服务

全基因组甲基化测序

DNA甲基化对生命活动非常重要,是基因调控的手段之一(即通过对位于启动子及第一外显子区的CpG岛的甲基化而抑制基因的表达),它在基因表达调控、肿瘤研究、染色质重塑、遗传印记、疾病研究、胚胎发育、环境与表观遗传和表观异质性等方面起至关重要的作用,是表观遗传学研究的热点。基于全基因组重亚硫酸盐转化的全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)方法,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准、高效定位。精准获得全基因组甲基化的C位点,是甲基化测序的金标准;全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响,快速准确地找到差异甲基化区域。具有“低成本、高效率、高准确度”的优势,已广泛应用于人和动植物研究。



方案设计


通过重亚硫酸盐对基因组DNA进行处理,将未甲基化的C碱基转化为U碱基,而甲基化的C则不会改变,进行PCR扩增后U碱基会变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来。WGBS精密度高,可以精确得到单个碱基,获得单碱基精度生物甲基化图谱。建议设置3个生物学重复,以消除组内误差并增强结果的可靠性。